Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptcd3Q14C51 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms