Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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ptchd1Q14B62 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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ptchd1Q14B62 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ptchd1Q14B62 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ptchd1Q14B62 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ptchd1Q14B62 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ptchd1Q14B62 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ptchd1Q14B62 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ptchd1Q14B62 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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ptchd1Q14B62 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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ptchd1Q14B62 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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