Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gli2Q0VGT2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms