Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms