Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd12Q0VE29 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms