Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms