Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBM2

Fam83b, Protein FAM83B, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83bQ0VBM2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms