Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms