Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms