Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms