Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms