Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms