Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MitfQ08874 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MitfQ08874 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
MitfQ08874 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms