Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms