Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms