Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms