Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aplp2Q06335 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms