Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms