Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms