Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apoc2Q05020 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apoc2Q05020 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Apoc2Q05020 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Apoc2Q05020 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Apoc2Q05020 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Apoc2Q05020 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Apoc2Q05020 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Apoc2Q05020 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms