Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top1Q04750 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top1Q04750 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top1Q04750 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms