Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cxcr5Q04683 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cxcr5Q04683 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cxcr5Q04683 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cxcr5Q04683 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cxcr5Q04683 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cxcr5Q04683 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cxcr5Q04683 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cxcr5Q04683 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cxcr5Q04683 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cxcr5Q04683 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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