Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelaQ04207 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelaQ04207 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelaQ04207 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelaQ04207 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RelaQ04207 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RelaQ04207 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms