Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms