Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms