Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gjb5Q02739 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gjb5Q02739 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gjb5Q02739 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Gjb5Q02739 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb5Q02739 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb5Q02739 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb5Q02739 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb5Q02739 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb5Q02739 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb5Q02739 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb5Q02739 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb5Q02739 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb5Q02739 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb5Q02739 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb5Q02739 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb5Q02739 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb5Q02739 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb5Q02739 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb5Q02739 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb5Q02739 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb5Q02739 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb5Q02739 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb5Q02739 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb5Q02739 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb5Q02739 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms