Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms