Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms