Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms