Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms