Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms