Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms