Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms