Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms