Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps45P97390 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms