Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Otx2P80206 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Otx2P80206 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms