Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeboxP70368 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeboxP70368 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeboxP70368 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeboxP70368 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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