Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux2P70298 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cux2P70298 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cux2P70298 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cux2P70298 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cux2P70298 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cux2P70298 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux2P70298 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux2P70298 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cux2P70298 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cux2P70298 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cux2P70298 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms