Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfixP70257 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfixP70257 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfixP70257 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NfixP70257 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfixP70257 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NfixP70257 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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NfixP70257 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfixP70257 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfixP70257 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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NfixP70257 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfixP70257 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfixP70257 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfixP70257 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfixP70257 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfixP70257 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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NfixP70257 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfixP70257 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfixP70257 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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NfixP70257 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfixP70257 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NfixP70257 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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NfixP70257 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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NfixP70257 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfixP70257 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfixP70257 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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NfixP70257 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfixP70257 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfixP70257 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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NfixP70257 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfixP70257 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfixP70257 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfixP70257 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfixP70257 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfixP70257 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfixP70257 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
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NfixP70257 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NfixP70257 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfixP70257 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfixP70257 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfixP70257 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfixP70257 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfixP70257 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfixP70257 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfixP70257 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NfixP70257 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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NfixP70257 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfixP70257 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfixP70257 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfixP70257 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfixP70257 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfixP70257 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms