Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chl1P70232 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chl1P70232 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chl1P70232 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms