Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Hoxd13P70217 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Hoxd13P70217 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Hoxd13P70217 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Hoxd13P70217 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Hoxd13P70217 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Hoxd13P70217 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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Hoxd13P70217 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Hoxd13P70217 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Hoxd13P70217 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Hoxd13P70217 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Hoxd13P70217 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Hoxd13P70217 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Hoxd13P70217 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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