Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf6P70196 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf6P70196 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf6P70196 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms