Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbdsP70122 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbdsP70122 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbdsP70122 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbdsP70122 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SbdsP70122 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbdsP70122 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbdsP70122 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms