Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrkcbP68404 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms