Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms