Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx1bP61264 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx1bP61264 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx1bP61264 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx1bP61264 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx1bP61264 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx1bP61264 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx1bP61264 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stx1bP61264 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stx1bP61264 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Stx1bP61264 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stx1bP61264 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Stx1bP61264 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stx1bP61264 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx1bP61264 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Stx1bP61264 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Stx1bP61264 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Stx1bP61264 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx1bP61264 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Stx1bP61264 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Stx1bP61264 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx1bP61264 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx1bP61264 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx1bP61264 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx1bP61264 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Stx1bP61264 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx1bP61264 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Stx1bP61264 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx1bP61264 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx1bP61264 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx1bP61264 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Stx1bP61264 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx1bP61264 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx1bP61264 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx1bP61264 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx1bP61264 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx1bP61264 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx1bP61264 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx1bP61264 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx1bP61264 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Stx1bP61264 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx1bP61264 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx1bP61264 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Stx1bP61264 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Stx1bP61264 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx1bP61264 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx1bP61264 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx1bP61264 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx1bP61264 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Stx1bP61264 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx1bP61264 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Stx1bP61264 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx1bP61264 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx1bP61264 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx1bP61264 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx1bP61264 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Stx1bP61264 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx1bP61264 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx1bP61264 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx1bP61264 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx1bP61264 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Stx1bP61264 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms