Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms