Protein–RNA interactions for Protein: P61082

Ube2m, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2mP61082 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2mP61082 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms