Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap25P60879 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap25P60879 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap25P60879 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap25P60879 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap25P60879 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap25P60879 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap25P60879 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap25P60879 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms