Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms